《拳皇99》是一款经典的街机游戏，进入新的篇章“N.E.S.T.S”篇。1999年的世界格斗大会仍然如期举行，这次大会由神秘组织的首领古力查利度举办。他通过大会收集各地格斗家的数据，并试图将他们克隆，以控制整个世界。他误以为K'是自己的克隆人，但没想到，自己其实是K'的复制品。在被K'击败后，古力查利度被克隆零宣布处死，并被N.E.S.T.S组织抹去全部记忆（其实他的记忆也是复制品）。
1、本身的技能连招等，都要通过战斗不断挖掘，召唤顶级高手互动挑战;
2、热血激战风格组合，在成长中高难度的对决，全新技能任意释放击杀敌人;
3、游戏中新颖的组合，选择3个高手进行配合，回合制的战斗激爽刺激对决。
1、多种难度设置，加深游戏体验
玩家可以从低难度慢慢打上去，让新手有一个缓冲时间，新手也能搞定大蛇。对于高手来说，也是分分钟就可以达到适合自己的难度，更多挑战等你来战!
2、 一键释放技能，人人都是高手
SP键的设置，更是方便了玩家，玩家可以根据自己的习惯或喜好，将人物任何一个技能设置成一个SP键，使之可以瞬间释放出去，即便是新手，也可以不费力气的放出华丽的技能。合理设置技能，可以使玩家水平更上一层楼。
3、隐藏人物解锁，BOSS也能选择
五个常用隐藏人物全免费，另外，玩家还可自行付费解锁隐藏人物：94草薙京和大蛇(两个人物的技能狠BT哦)，相信有这两位人物相助，通关也不在话下。
KOF99的故事进入了NESTS篇，主人翁 由一直以来的京换成了K’。
“召开KOF”——世界各地的格斗家们又收到了邀请函。格斗之王大会将再一次召开!但是这次的气氛似乎有些不同。在招待者的背后，似乎完全没有那种世界大会般规模的支持者。在格斗们觉得不可思议 的时候，对战形式又出现了新规定。
游戏界面“对战形式仍为3对3，但大会采用援护战斗的形式。”
“援护战斗!”，听到这个陌生名词的格斗家 们掩饰不住脸上的困惑。感觉到有些火药味的哈迪伦 示意拉尔夫 等人参加战斗，查明大会开展的真相。
其中，二阶堂红丸 也作为特别队的一员收到了邀请，预备出席KOF。队友的名字是K’以及马克 西玛(MAXIMA )。但是在以前的格斗界中，红丸对这两个名字闻所未闻。满怀心事的红丸以及格斗家 们分别动身前往指定地点，他们心中充满疑惑——援护模式是什么 ?这次举办的大会又有什么内幕?满是谜团的KOF即将再掀风雨!
在KOF99大会开始不久，世界各地出现大批克隆人战士和改造人战士出现，它们的背后，是阴森庞大的神秘组织——NESTS。而克隆人的相貌，赫然竟是世人心目中的英雄——草薙京 。
京和庵的足迹已成传说。真正的京，到底在哪里?庵呢?那OROCHI空间毁天灭地的一战，到底换来了怎样一个结局?
—没有了模式选择，而改为所有人物通用的最大蓄满三颗宝珠的能量槽。
—取消了能量槽的继承系统。
—缩短了紧急回避的距离，加快了紧急回避的时间。
—首次引入STRIKER和SUPER CANCEL的概念，并且新增爆气发动的反击模式和防护模式。
—对战模式也更改为4VS4，启用了创新的援护系统，队伍中第四人作为援护，可发动援护攻击。
1、Q版人物每个看起来都很可爱，再给他们购买可爱的服装搭配，更加凸显其特点。
2、四种不同的英雄可供选择，每个英雄的不同之处都很多，建议大家都先熟悉一下。
3、只有一个大招是一直存在的，其他的特技都需要随机学习，使得战斗更加有乐趣。
1、数十位熟悉的KOF角色享受并肩作战的乐趣
2、还原街机打斗玩法，重温童年游戏的经典回味。
3、众多boss带来丰富热血的战斗冒险，刺激不断挑战
4、震撼的大招特效，让玩家享受华丽的视觉盛宴
